한국고등교육재단 부설 사회적기업연구소는 사회적 기업에 대한 특화된 연구 기능 수행과 지원을 통해 관련 분야의 이론을 체계적으로 정립하고 해외 선진 기관들의 사례를 조사·전파하는 한편, 국내외 기관과의 협력을 통해 사회적 기업 관련 지식을 확산하고자 2013년 설립되었다. 국내외 주요 대학 내 사회적 기업 관련 연구 센터와의 협력 연구 사업, 정부-민간-학계 네트워크를 활용한 연구 과제 수행, 한국고등교육재단 주관 국제 학술 포럼에서의 사회적 기업 세션 운영 등 다양한 방식의 사회적 기업 관련 활동 및 연구 과제들을 수행하고 있다.